菊花苗扦插之后初期，需要结合天气变化调控空气湿度与温度。大面积扦插育苗多采用全日照喷雾法，小面积育苗可选用遮阴配合薄膜的育苗方式。
全日照喷雾法是生产秋菊及寒菊种苗较为成熟有效的手段。秋菊、寒菊育苗多在高温低湿的夏季开展，全日照喷雾可以为插穗提供适宜高温、长光照的生根环境，利于插穗生根。全日照喷雾分为间歇性喷雾与连续性喷雾，连续性喷雾耗水耗电，较少使用，一般选用间歇性喷雾。白天开展喷雾作业，阴雨天、晴天早晚停止喷雾，以叶面维持有水膜为操作原则。
遮阴法多用于夏季小面积扦插育苗，配合人工喷雾，保证插穗挺拔不萎蔫。扦插初期中午时段覆盖遮阳网，其余时段撤去遮阳网，同时增加喷雾频次；后期撤掉遮阳网，依据天气情况调整喷雾频次与用水量，以插穗不出现萎蔫为标准。
薄膜法多用于冬春低温环境扦插。扦插完成浇透底水，用薄膜密闭覆盖插床，实现增湿效果。每日定时检查，插穗无萎蔫现象无需揭开薄膜；一旦出现萎蔫，及时喷雾补水。该方式需要防范晴日棚内温度过高灼伤幼苗，夏季一般不使用，避免损伤插穗。插穗生根后及时揭除薄膜，加强通风透光，促使幼苗长势健壮，提升抗逆能力。
无论选用哪一种管理方式，为降低插穗病害感染风险，插床周边以及插穗都需要喷施药剂，定期施用百菌清、多菌灵等广谱杀菌剂。发现插穗腐烂，应立刻拔除病株，并对周边区域加强防护，阻断病菌扩散。
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